涡轮分子泵是高或超高真空泵，主要由转子和定子两个部分组成。一个旋转的转子盘和一个静止的定子盘组成了一个泵级，泵级产生一个特定的压缩比。通过连续开启增加压缩效果的多个泵级，可以获得高达 1013的压缩比。

对于带有额外压缩级的涡轮分子泵，其前真空压力可以上升至 30 hPa以上。对于带有纯涡轮级的分子泵，最大前真空压力为 2-3hPa，但是这取决于抽送气体的种类，如氮气为 2 hPa，氢气为 0.5 hPa。由于泵的过热，超过生产商指定的最大压力会导致轴承受损，情况严重的甚至会导致彻底失效。气体摩擦上升过高，且额外产生的压缩热无法消散。对于轴承和转子温度未受监测的泵，这尤其重要，且在很多情况下，是不可避免的。通过使用最终压力为2-5 hPa 的隔膜泵，操作员就可以带动设备的运行。除了隔膜泵，干式泵没有任何出口阀门。如果前级泵发生故障，将从前级侧对处理室进行排气。

而且，如果由此导致涡轮分子泵速度的下降并没有因前级压力的快速上升而引发自动排气过程。由于外壳中所谓的直升飞机效应，大型处理室的突然排气会导致涡轮分子泵转子受损。

涡轮分子泵标注排气管道的尺寸建议至少按照泵的标称尺寸安装排气管道和阀门，因为不良电导值会导致抽速显著下降。以下是稍加夸大的案例，以说明在直径为 25 mm、长度为 100 mm 的进气管内电导值损失所造成的影响。涡轮分子泵有效抽速与标称抽速：60 l/s:10 l/s，5000 l/s:14 l/s。

如果分子泵的高真空法兰连接至接受器，则有必要让前级管道更为灵活。如果前级管道为固定连接，则泵壳受热后无法膨胀，导致不当的材料应力。在该固定连接中，转子无法自由移动，且遗留下来的细微不平衡随着时间的推移会造成轴承故障，并会导致转子受损。保持涡轮分子泵平衡性可以确保低振动运转和最佳的轴承耐用性。在正常启动过程中，根据转子动力学，他们通过某种特定的共振频率。

如果这些共振频率够刺激真空室、框架或整个系统的固有频率，他们就可以促进频率振幅的显著提升；在这种频率下，泵开始剧烈振动并发出非常大的声音。频繁在这些共振频率区域运行会导致转子受损，且可能会导致设备或内置振动敏感元件损坏。即便是带有磁轴承的涡轮分子泵也不例外。因此，最好确定系统的固有频率，并就相关数值向制造商进行咨询。通过加固、增加额外重量或变换设计方案等可以避免振动的发生。

涡轮分子泵，尤其是抽速在 1000l/s 以上、带有磁轴承和钟形转子的较大涡轮分子泵，在额定转速下具有较高的扭矩，在转子碰撞时，速度会以毫秒为单位降级。如果真空室布局不当且涡轮分子泵直接安装在其上时，则会发生真空室变形的情况，情况最严重时还会造成涡轮分子泵扭曲，甚至会与真空室法兰脱离。

近年来，主要受到半导体工业的驱动，泵制造商已经通过碰撞实验和控制分析对泵壳和入口法兰上的力矩和受力进行了确定和测试。实验发现，连接到真空室的法兰原则上应该按ISO-F执行。通过长圆孔及使用 ISO-CF 与固定螺钉，防止带 ISO-F 法兰的泵发生转动。

最后在涡轮分子泵的高真空法兰上插入防护罩，以避免坠落碎片损坏转子。根据电导损耗，抽速降低达30%，具体视气体类型而定。如可能，涡轮分子泵应该在真空室内倒置放置，因为异物会因重力而掉落下来。确保泵可用于高空作业

当烘烤泵时，务必遵守生产商规定的最大高真空法兰温度为 120°C 的要求。超过允许的温度会导致泵过热，并会造成轴承或转子受损。烘烤时，需要用水对泵进行冷却。默认情况下，一些生产商为具有 ISO-CF-F 法兰的超高真空版本提供水冷却。烘烤过程至少需要 6 个小时。

如果旋片泵用作前级泵，当前真空至高真空之间压力已经平衡时，没有经过排气的涡轮分子泵在停止转动后会受到碳氢化合物的污染。如果高真空侧尚未安装阀门，那么污染物将会扩散到接收器或设备中。对于大型腔室来说，气体吸入非常迅速，这可能会导致转子受损。使用干燥的气体，如氮气或无油空气，对泵进行排气，既可以防止污染，还可以恰当地对前级泵进行充气。

以一定的速度使用排气阀、利用涡轮分子泵控制器，可对泵进行安全的排气。由于涡轮分子泵的压缩比还取决于速度，因此最优初始排气速度应该为额定速度的50%，且应该以最近速度的20%开始。除了出厂设置以外，现代电子技术允许排气速度具有一定的灵活性。在适当的排气后，使用球轴承涡轮分子泵还能够保护接收器免受污染。存在这样一些过程，在其中，与泵无关的排气要优先于控制系统。这将导致与泵速有关的重要连接受损。

当对泵的控制器进行排气时，无需对泵速进行额外监控。在排气时，泵的内表面被干燥的氮气覆盖，这将显著缩短排放时间，因为不存在难以去除的气体或水聚集在表面。排气气体不可从前级侧进入，因为凝结物、颗粒甚至是油可能会被带入到高真空侧。